La sélection génétique d'animaux moins émetteur de méthane est une des pistes travaillées pour réduire les émissions de gaz à effet de serre en élevage. L'idele propose ce point d'étape pour mieux comprendre les avancées de la sélection génétique sur ce sujet. Avec un premier index pilote à la clé.
28 millions de spectres MIR de lait collectés
L’UMT eBIS* a développé des équations permettant de prédire les émissions de méthane d’une vache à partir des spectres MIR du lait. Plusieurs prédictions sont étudiées : • les émissions de méthane en g/j (MeP direct) ; • les émissions de méthane en g/kg de lait corrigé pour les taux (MeI) ; • les émissions de méthane en g/j obtenues en multipliant la prédiction MeI par la production laitière corrigée pour les taux (MeP_indirect) ; • les émissions de méthane en g/j obtenues avec l’équation développée dans le cadre du Consortium Méthane et utilisée dans le réseau OptiMIR (MeP_GHG).
28 millions de spectres MIR, collectés entre 2012 et 2023 par les établissements de contrôle laitier. Elles ont permis de développer et fournir un module de calcul à l’ARSOE ESTEL, pour obtenir des prédictions d’émission de méthane.
Ces émissions de méthane prédites par MIR sont utilisées comme phénotypes pour des analyses génétiques. « Ici, seuls les spectres collectés entre 70 et 200 jours de lactation ont été considérés, une étude complémentaire ayant mis en évidence une forte proportion de prédictions non fiables en début et en fin de lactation ».
Une héritabilité modérée des prédictions d’émissions de méthane
Pour chacune des huit races concernées, l’héritabilité – la part de variabilité phénotypique due à la variabilité génétique, et donc la variabilité transmissible – est modérée pour les quatre caractères, variant entre 0,2 et 0,4, permettant d’envisager une sélection génomique sur ces caractères. A titre de comparaison, des caractères comme les mammites cliniques et la fertilité (taux de non-retour) déjà en sélection présentent des héritabilités inférieures à 0.03.
Un index de synthèse pour une sélection pertinente
Les corrélations génétiques entre les quatre caractères d’émission de méthane ont également été estimées. Les caractères se révèlent être génétiquement distincts, et ce pour toutes les races. C’est-à-dire que la sélection des meilleurs individus sur l’un des quatre caractères ne permettra pas de sélectionner les meilleurs individus sur les trois autres caractères. C’est pourquoi le consortium Méthabreed et l’UMT eBIS encouragent l’utilisation d’un index de synthèse 50% MeP_direct et 50% MeP_GHG. S’appuyer sur ces équations de prédiction permettrait une sélection simultanée sur les deux caractères présentant la plus forte corrélation génétique mais aussi de limiter l’erreur associée à chacune des équations.
Des évaluations pilotes à l’étude pour envisager une mise en production
Des évaluations pilotes ont été réalisées avec la méthodologie single-step pour chacune des huit races. En s’appuyant sur les populations de référence, ces évaluations ont permis le calcul des index pilotes pour les quatre caractères d’émission de méthane élémentaires (MeP_direct, MeP_indirect, MeP_GHG et MeI) et de la synthèse proposée par l’UMT eBIS (50% MeP_direct et 50% MeP_GHG) pour l’ensemble des animaux typés ou disposant de performances dans le cadre du projet. Ces index ont été fournis aux Organismes et aux Entreprises de Sélection des races concernées au printemps 2024 afin qu’ils décident de ce qu’ils souhaitent voir transférer chez GenEval à partir de l’été 2024.
Définir quel poids associer au méthane dans les objectifs de sélection
C’est une nouvelle phase dans le projet MethaBreed. L’UMT eBIS évalue les corrélations génétiques avec les autres caractères en sélection : production laitière, morphologie, santé et fertilité. « Une fois ces corrélations obtenues, des études de réponse à la sélection permettront d’estimer le poids à associer au méthane dans les objectifs de sélection pour permettre une réduction des émissions de méthane tout en maintenant un progrès génétique satisfaisant pour les autres caractères ».
* En partenariat avec le Centre de Recherche Agronomique Wallon (CRA-W) et l’université de Gembloux,